茄子枯萎病主要危害根莖部。苗期和成株期均可發生。苗期染病，開始子葉發黃，后逐漸萎垂干枯，莖基部變褐腐爛，易造成猝倒狀枯死。

茄子枯萎病常伴隨著黃萎病發生，是保護地栽培的重要病害。植株多在成年期發病，病株頂部葉片缺水狀萎蔫，逐漸萎蔫加重變黃，最后從下部葉片逐漸向上變黃枯萎死亡。有時同一葉片僅半邊變黃，另一半健全如常。解剖病莖，可見病部維管束呈褐色。

多自下而上或從一邊向全株發展。葉片初在葉緣及葉脈間變黃，后發展至半邊葉片或整片葉變黃，早期病葉晴天高溫時呈萎蔫狀，早晚尚可恢復，后期病葉由黃變褐，終致萎蔫下垂以致脫落。

發病初期，病株葉片自下而上逐漸變黃枯萎，病癥多表現下部葉片，有時同—葉片僅半邊變黃，另一半健全如常；主要是葉脈變黃，最后整個葉片枯黃，葉片不脫落。剝開病莖維管束呈褐色。